疾控中心污水处理装置水质特点是含有大量的病原体──病菌、病毒和寄生虫卵。如结核病医院污水，每升可检出结核杆菌几十万至几百万个。医院污水还含有消毒剂、药剂、试剂等多种化学物质。利用放射性同位素医疗手段的医院的污水还含有放射性物质。医院污水的水量与医院的性质、规模及所在地区的气候等因素有关，按每张病床计一般为每天200～1000升。
医院污水排放一般分两部分：一部分为生活污水，一部分为相关病床及医院产生的污水。针对进出水的水质水量要求医院污水处理所用工艺必须确保处理出水达标，主要采用的三种工艺有：加强处理效果的一级处理、二级处理和简易生化处理。
正确使用和恰当的保养才能使疾控中心污水处理装置处于良好的状态，其管理方法如下：
1、做好管理工作：从设备购置一安装一验收一保养→检修报废更新全过程的管理工作。
2、使用要小心：各种设备都要有操作规程，根据制造厂的说明书和现场情况相结合，而工人需严格按照操作规程进行操作设备使用过程中要作工况记录。
3、及时检修：对主要设备应制定设备检修标准。通过检修、恢复技术性能要制定定期保养检修周期，实行定期检修，应制定检修工料定额以降低检修成本并每次检修都应详细记录备查。
4、要做好保养：疾控中心污水处理装置要制定保养条例保养，定期保养定期停机检查保养，停放保养指备用机组或闲置设备的保养，换季保养指设备入夏、入冬或雨期等季节性，需要的保养工作包括采取防晒防寒防潮降温等措施。
